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抗原加工、呈递与 MHC

适应性免疫先把复杂病原体拆解为受体能够读取的局部结构。B 细胞受体(B-cell receptor,BCR)和抗体可以直接接触蛋白、糖、脂质或小分子表面的结构,常规 αβ T 细胞受体(T-cell receptor,TCR)则主要读取细胞表面的“肽—主要组织相容性复合体”组合。细胞先取得蛋白质,在特定区室将其加工成肽,再把合适片段装入 MHC 分子的结合沟槽;T 细胞由此能够检查本来位于胞质、囊泡或细胞外的蛋白质。1

这套过程把分子降解、膜交通和淋巴细胞选择接到一起。蛋白酶切出的片段中只有一部分能被某个 MHC 等位基因稳定结合,形成的肽—MHC 复合物又只有一部分遇得到相应 T 细胞克隆。抗原是否产生应答,因而取决于摄取、加工、装载、细胞状态、宿主基因和淋巴细胞库的连续筛选;分子的来源与大小是其中两个变量。

抗原、免疫原与表位描述不同层次

抗原是能被抗体、BCR、TCR 或其他特异性免疫受体识别的对象;免疫原则能在给定宿主和条件下诱导免疫应答。一个分子可以与既有抗体结合,却因剂量、进入途径、先天激活、呈递效率或相应细胞克隆频率等条件而无法单独诱导显著应答。免疫原性是分子性质与宿主情境共同产生的结果;抗原性描述特异性识别,免疫原性描述诱导应答的能力。2

表位是某一克隆受体实际接触的局部结构。同一蛋白含有许多可能重叠的表位,因而可同时招募多个 B、T 细胞克隆。B 细胞和抗体常识别天然分子表面的构象表位,也能识别连续序列表位;构象表位可由一级序列中相距很远的残基在折叠后共同形成。常规 αβ T 细胞识别的蛋白表位则通常是加工后装入 MHC 的短肽,原蛋白内部原本不可接近的序列也能成为 T 细胞表位。3

半抗原是能被特异抗体或 BCR 结合、通常需要载体帮助才产生充分免疫原性的小化学基团。它与载体蛋白共价连接后,重复半抗原可促进 BCR 交联,载体又提供能由 MHC II 呈递的肽,使载体特异性辅助 T 细胞向半抗原特异性 B 细胞提供帮助。这种关联识别解释了半抗原—载体实验,也构成蛋白结合多糖疫苗的免疫学基础。核酸、多糖和脂质各自的免疫原性取决于结构、重复性、受体与递送环境,半抗原身份则取决于结合能力和载体依赖性。4

细菌荚膜、细胞壁、鞭毛、菌毛和毒素都可提供抗原,每种成分还可能含有多个表位。不同物种或分子共享相似表位时,既有抗体或 TCR 可能发生交叉反应;强弱取决于接触面的保守程度、受体亲和力和多价几何。凝集吸收等传统方法怎样利用交叉反应区分抗体,见免疫检测

肽—MHC 的表面展示与限制性

主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)最初因移植排斥中的强遗传效应得名,其持续的生理任务是装载细胞产生的肽并将其展示给 T 细胞。人的 MHC 称人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)系统。常规 αβ TCR 同时接触肽和 MHC 沟槽边缘,识别对象是两者共同构成的完整肽—MHC 表面。Doherty 与 Zinkernagel 的病毒感染细胞实验所揭示的 MHC 限制,后来由肽—MHC—TCR 的分子结构得到解释。5

MHC I 由一条跨膜 α 重链与 β₂-微球蛋白组成,肽结合沟槽位于 α1、α2 结构域之间,两端相对封闭,常容纳 8—10 个氨基酸的肽。MHC II 由跨膜 α、β 两条链组成,沟槽两端开放,常结合约 13—17 个或更长的肽,肽两端可伸出沟槽。等位基因间差异集中在沟槽口袋,某些肽侧链作为锚定残基插入口袋,其余朝上残基与 MHC 表面共同构成 TCR 可读取的形状。6

CD8 结合 MHC I 重链较保守的 α3 区域,CD4 结合 MHC II 的非多态区域。两种共受体既稳定细胞接触,也把 Lck 等信号分子带到 TCR—CD3 复合体附近,因此 CD8 与 MHC I、CD4 与 MHC II 的配对同时具有结构和信号意义。成熟 T 细胞的相应限制性由胸腺选择建立,见淋巴细胞发育与受体多样性

MHC I 对胞质蛋白的持续抽样

经典 MHC I 表达于多数有核细胞,使组织细胞可以报告自身胞质和细胞核蛋白的组成。呈递库包含正常自身蛋白、病毒或其他胞内病原体蛋白、肿瘤突变蛋白以及快速失败的新生蛋白产物。蛋白质周转产生的底物经泛素—蛋白酶体系统等途径降解;炎症和干扰素可诱导免疫蛋白酶体亚基,改变部分切割偏好,但常规蛋白酶体同样持续提供 MHC I 肽源。7

蛋白酶体产生的胞质肽主要由抗原加工相关转运体(transporter associated with antigen processing,TAP)TAP1/TAP2 送入内质网。过长肽的氨基端可由内质网氨肽酶(endoplasmic reticulum aminopeptidase,ERAP)等修剪;新合成的 MHC I α 链先与 β₂-微球蛋白装配,再由钙网蛋白(calreticulin)、ERp57、tapasin 和 TAP 等组成的肽装载复合体协助取得稳定配体。合适肽进入沟槽后提高 MHC I 的稳定性,复合物经高尔基体到达质膜;空载或结合不稳的分子更容易被保留、回收或降解。少数肽可经 TAP 非依赖或经典蛋白酶体非依赖路线产生,这些支路与上述主干共同构成 MHC I 肽库。8

MHC I 通路呈现经过多级筛选的抽样结果。底物生成速率、蛋白酶体切口、TAP 转运偏好、ERAP 修剪、等位基因结合基序和复合物寿命会连续改变肽的丰度。感染细胞表面仍以自身肽为多数;少量病原肽—MHC 遇到相应效应 CD8 T 细胞便可能触发细胞毒反应。杀伤程序见T 细胞激活与效应

MHC II 对内吞货物的呈递

经典 MHC II 持续高表达于树突状细胞、B 细胞和巨噬细胞,并见于胸腺上皮等专门细胞;炎症因子还可在部分其他细胞诱导表达。胞外蛋白经受体介导内吞、吞噬或大胞饮进入内体—溶酶体系统,酸化和 cathepsin 等蛋白酶使其展开并分段。B 细胞借 BCR 选择性浓缩相应抗原,巨噬细胞擅长吞噬并向已分化效应 T 细胞呈递,树突状细胞则把广泛取样与初始 T 细胞启动连接起来。9

MHC II 的 α、β 链在内质网合成时与不变链(invariant chain,Ii/CD74)装配。不变链占据肽沟槽,避免内质网肽过早结合,其胞质尾又把复合物导向酸性内体。蛋白酶逐步降解不变链后,沟槽中留下 class II-associated invariant chain peptide(CLIP);HLA-DM 催化 CLIP 释放和肽交换,并偏向保留较稳定的肽—MHC II 复合物,HLA-DO 可在特定细胞与状态下调节 DM。装载后的复合物运到表面供 CD4 T 细胞检查。10

胞外蛋白经内吞进入 MHC II 是主要物流方向,自噬也可把胞质成分送入溶酶体相关区室,膜蛋白则随内吞和更新进入 MHC II 加工系统。进入内体的抗原还可能转入 MHC I 通路。两类 MHC 的差异来自优先使用的细胞区室、装载机器和表达细胞,同时保留这些交叉来源。

树突状细胞的交叉呈递

某些病毒不感染树突状细胞,肿瘤抗原也可能主要位于转化细胞内。cDC1 等树突状细胞可以摄取感染细胞、肿瘤细胞或其碎片,再把外源性蛋白产生的肽装入自身 MHC I,这一过程称交叉呈递。抗原可从吞噬体转入胞质并使用蛋白酶体、TAP 等装置,也可在囊泡内完成某些切割和装载;不同抗原和细胞使用的路线权重不同。11

交叉呈递描述肽怎样到达 MHC I,交叉启动(cross-priming)则描述这种呈递最终使初始 CD8 T 细胞增殖并取得效应功能。相同呈递在缺少炎症和共刺激时也可能促进交叉耐受。特定肽—MHC I 的表面展示需要与呈递细胞的成熟状态和伴随信号结合,才能判断应答方向。

树突状细胞还可从其他细胞获得已经装载好的完整肽—MHC 复合物并直接展示,称为交叉装扮(MHC cross-dressing,也译交叉修饰)。它省略了受体细胞内的再加工,与“摄取蛋白后重新装载”的交叉呈递属于不同机制;实验中需要用供、受体 MHC 来源和加工依赖性将二者区分。12

呈递细胞状态、共刺激与启动

多数有核细胞都能用 MHC I 向已经形成的 CD8 效应细胞报告胞内肽,却通常缺少启动初始 T 细胞所需的完整装置。树突状细胞在组织摄取抗原和感知危险后,上调 MHC、CD80/CD86、CCR7 与存活程序,迁入引流淋巴结,在同一细胞表面把抗原特异性和炎症背景交给稀少的初始 T 细胞。“专业抗原呈递细胞”(professional antigen-presenting cell,APC)强调加工抗原并有效启动 T 细胞的能力;MHC 表达则具有更广的细胞范围。13

初始 T 细胞激活常用三个层次描述:TCR 与肽—MHC 加上 CD4/CD8 提供抗原特异性信号,CD80/CD86 与 CD28 等组合提供共刺激,呈递细胞和组织产生的细胞因子塑造分化方向。只得到 TCR 信号的细胞可能进入无反应、删除或其他耐受结局;同一肽在成熟树突状细胞和稳态组织细胞上出现,免疫后果因此可以不同。三类信号在时间和空间上相互影响,共同形成连续而有情境依赖性的激活过程。14

B 细胞和巨噬细胞在已经建立的应答中同样重要。BCR 把低浓度蛋白浓缩并送入 MHC II 通路,使 B 细胞能从识别同一分子复合物的辅助 T 细胞获得关联帮助;巨噬细胞呈递吞噬对象产生的肽,可从效应 CD4 T 细胞得到进一步激活。初始启动、效应细胞回访和 B 细胞帮助发生在不同细胞组合与阶段,构成多阶段的呈递网络。

HLA 多样性塑造个体的呈递范围

人的经典 MHC I 基因主要为 HLA-AHLA-BHLA-C,经典 MHC II 主要为 HLA-DPHLA-DQHLA-DR。这些基因位于 6 号染色体短臂的紧密区域,每条同源染色体携带的一组连锁等位基因构成 HLA 单倍型;来自父母的等位基因通常共显性表达。所谓 MHC III 区包含补体和炎症相关基因,却不产生另一类用于呈递的“MHC III 分子”。15

HLA 位点具有极高多态性,许多变异集中在肽结合沟槽,改变可容纳的锚定残基和肽谱。多基因、共显性表达使一个杂合个体能同时展示多组肽,但任何个体都只携带群体等位基因库的一小部分。某种病原肽在一个人中成为优势表位,在另一 HLA 背景中可能结合很弱;特定 HLA 等位基因也可改变感染控制、药物超敏或自身免疫风险。关联表示呈递和选择机制受到影响,个体结局还取决于其他遗传与环境因素。正式等位基因命名和序列以 IPD-IMGT/HLA 数据库为准。16

同一抗原最终常只激发针对少数优势表位的强 T 细胞应答。蛋白丰度和稳定性、摄取与切割、TAP 和修剪、肽—MHC 结合稳定性、表面复合物寿命、相应 T 细胞前体频率及克隆间竞争都会参与这套免疫优势层级。MHC 结合预测覆盖其中一层,天然加工、表面展示和 T 细胞反应还需要相应实验分别证明。17

免疫肽组学将细胞表面的 MHC 复合物免疫富集,洗脱其结合肽并用质谱鉴定,从而直接观察某种细胞在给定状态下展示的肽库。该方法仍受样本量、HLA 归属、低丰度肽和质谱检出偏好限制;检测到肽证明展示发生过,能否激活 T 细胞还需用肽—MHC 多聚体、功能测定或其他受体层证据检验。18

非经典呈递扩展了可被读取的化学空间

T 细胞还可读取肽以外的分子。CD1 家族具有与 MHC I 相似的折叠,却以疏水沟槽结合脂质及糖脂,并由 NKT 细胞等 T 细胞群识别;MR1 能呈递微生物核黄素合成途径产生的某些小分子代谢物,激活黏膜相关不变 T 细胞(mucosal-associated invariant T cell,MAIT cell)。HLA-E 常结合经典 MHC I 信号肽来源片段,并通过 CD94/NKG2 受体向自然杀伤细胞(natural killer cell,NK cell)报告 MHC I 装配状态,也可在特定情境呈递其他肽给 T 细胞。19

这些系统的分子多态性、配体来源和受体库不同于经典 HLA-A/B/C 与 DP/DQ/DR,共同扩展了抗原呈递的化学空间。“抗原呈递”的核心是把细胞内部或环境中的化学信息稳定放到细胞表面,供具有相应受体的淋巴细胞检查。

参考资料与延伸阅读

  • Murphy K, Weaver C, Berg LJ. Janeway's Immunobiology. 10th ed. W. W. Norton, 2022.
  • Pishesha N, Harmand TJ, Ploegh HL. A guide to antigen processing and presentation. Nature Reviews Immunology. 2022;22:751–764.
  • Neefjes J, Jongsma MLM, Paul P, Bakke O. Towards a systems understanding of MHC class I and MHC class II antigen presentation. Nature Reviews Immunology. 2011;11:823–836.
  • Roche PA, Furuta K. The ins and outs of MHC class II-mediated antigen processing and presentation. Nature Reviews Immunology. 2015;15:203–216.
  • Joffre OP, Segura E, Savina A, Amigorena S. Cross-presentation by dendritic cells. Nature Reviews Immunology. 2012;12:557–569.
  • Dendrou CA, Petersen J, Rossjohn J, Fugger L. HLA variation and disease. Nature Reviews Immunology. 2018;18:325–339.
  • Rossjohn J, Gras S, Miles JJ, Turner SJ, Godfrey DI, McCluskey J. T cell antigen receptor recognition of antigen-presenting molecules. Annual Review of Immunology. 2015;33:169–200.

  1. BCR/抗体直接识别多类天然结构,而常规 αβ TCR 识别肽—MHC 复合物的教材框架,参见 NCBI Bookshelf Summary to Chapter 3与 Pishesha 等 A guide to antigen processing and presentation。 

  2. 抗原、免疫原、表位与半抗原的术语边界,参见 NCBI Bookshelf Immunobiology Glossary。 

  3. B 细胞天然构象识别与 T 细胞加工后肽识别的差别,参见 NCBI Bookshelf Summary to Chapter 3Specific Acquired Immunity。 

  4. 半抗原—载体、关联识别和多糖结合疫苗的逻辑,参见 NCBI Bookshelf B-cell activation by armed helper T cells。 

  5. MHC 限制的实验发现、病毒肽与自身 MHC 共同构成 TCR 配体,参见诺贝尔奖官方 1996 年生理学或医学奖新闻稿。 

  6. MHC I/II 的亚基组成、沟槽两端结构、常见肽长和锚定残基,参见 NCBI Bookshelf T Cells and MHC ProteinsAntigen recognition by T cells。 

  7. 胞质和核蛋白、蛋白酶体/免疫蛋白酶体与新生或周转蛋白进入 MHC I 肽库,参见 Neefjes 等 Towards a systems understanding of MHC class I and MHC class II antigen presentation。 

  8. 蛋白酶体、TAP、ERAP、β₂-微球蛋白和肽装载复合体的顺序与质量控制,参见 Pishesha 等的抗原加工指南及 Jhunjhunwala 等 Antigen presentation in cancer。 

  9. 树突状细胞、B 细胞、巨噬细胞和胸腺上皮的 MHC II 表达、取样及呈递差异,参见 Roche 与 Furuta The ins and outs of MHC class II-mediated antigen processing and presentation。 

  10. 不变链、CLIP、酸性内体、HLA-DM/DO 和 MHC II 肽编辑,参见 NCBI Bookshelf Major histocompatibility complex: antigen processing and presentation及 Roche 与 Furuta 的综述。 

  11. 外源抗原进入 MHC I、胞质与囊泡路线及交叉启动/耐受边界,参见 Joffre 等 Cross-presentation by dendritic cells。 

  12. 完整肽—MHC 从供体细胞转移给树突状细胞且无需重新加工的原始证据,参见 Wakim 与 Bevan Cross-dressed dendritic cells drive memory CD8 T-cell activation after viral infection。 

  13. 初始 T 细胞启动需要抗原呈递和共刺激由同一活化 APC 提供的教材证据,参见 NCBI Bookshelf The production of armed effector T cells;细胞身份和迁移路线见免疫细胞、组织与迁移。 

  14. CD80/CD86—CD28 共刺激、缺少共刺激时的无反应或删除,参见 NCBI Bookshelf Helper T Cells and Lymphocyte Activation;分化程序和负调节见 T 细胞与耐受页面。 

  15. 经典 HLA-A/B/C 与 DP/DQ/DR 的基因和蛋白组成,参见 NCBI Bookshelf Histocompatibility;人 HLA 正式命名与序列由 IPD-IMGT/HLA Database维护。 

  16. HLA 多态性、沟槽变异和疾病机制边界,参见 Dendrou 等 HLA variation and disease;等位基因—疾病关联不能独立证明个体结局。 

  17. 抗原加工、肽稳定性、T 细胞前体与竞争共同塑造免疫优势,参见 Sercarz 与 Maverakis MHC-guided processing及 Kim 等 Divergent paths for the selection of immunodominant epitopes。 

  18. MHC 免疫富集、结合肽洗脱、质谱鉴定及方法局限,参见 Bruno The genomics revolution comes to the immunopeptidome及 Arshad 等 Immunopeptidomics for autoimmunity。 

  19. CD1 对脂质、MR1 对小分子代谢物的呈递,参见 McWilliam 等 Lipid and small-molecule display by CD1 and MR1;HLA-E 与 NK 受体的关系参见 Braud 等 HLA-E binds to natural killer cell receptors CD94/NKG2A, B and C。 

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