糖类¶
糖类的碳骨架上密集排列着羟基,并保留一个能够表现醛或酮化学的潜在羰基。这个组合使单糖既容易与水形成氢键,又能通过环化产生新的立体中心,还能从异头碳出发连接成线性或分支的糖链。葡萄糖进入糖酵解时是碳和能量的来源,纤维素与几丁质形成承力材料,细胞表面的寡糖则把细微的连接位置和立体差异转化为分子识别信息。
理解糖类需要沿着“单糖构型—糖苷键—聚合物构象”这一结构链条展开。单糖的构型决定糖苷键的空间方向,糖苷键又决定聚合物能否卷曲、分支或排列成纤维;同一种单糖残基只要改变连接碳、异头构型或取代基,便可能形成物理性质和生物功能完全不同的分子。
糖类的范围与结构层级¶
国际纯粹与应用化学联合会—国际生物化学与分子生物学联合会(IUPAC–IUBMB)将糖类的范围扩展到单糖、寡糖、多糖,以及由单糖经还原、氧化或羟基取代形成的醛糖醇、糖酸、脱氧糖和氨基糖等衍生物。母体单糖通常是含三个或更多碳原子的多羟基醛或多羟基酮;“糖”则更多用于单糖和较小的寡糖。肌醇等环多醇与糖代谢关系密切,但在这套命名中归入环醇而非严格意义上的糖类。1
| 结构层级 | 组成与连接 | 代表分子 | 主要生物学语境 |
|---|---|---|---|
| 单糖 | 由一个糖单位构成,不与其他糖单位形成糖苷连接;包括具有潜在羰基的母体及其衍生物 | 葡萄糖、核糖、果糖、N-乙酰葡糖胺(N-acetylglucosamine,GlcNAc)、N-乙酰神经氨酸(N-acetylneuraminic acid,Neu5Ac) | 代谢中间体、核酸组分和糖链单体 |
| 寡糖 | 少量单糖以糖苷键连接;残基数上限是约定而非天然断点 | 麦芽糖、蔗糖、棉子糖、人乳寡糖 | 营养、运输、细胞识别和蛋白质质量控制 |
| 多糖 | 较多残基构成的线性或分支聚合物,常含重复结构 | 淀粉、糖原、纤维素、几丁质、糖胺聚糖 | 储存、机械支撑、保水和表面屏障 |
| 糖缀合物 | 糖链与蛋白质、脂质或其他配基共价连接 | 糖蛋白、蛋白聚糖、糖脂、脂多糖 | 膜与细胞外基质、信号和宿主—微生物相互作用 |
“寡糖”和“多糖”的界线在不同教材与研究领域中并不一致。比残基数更有解释力的是结构组织:多糖往往由重复单元延伸成大分子,寡糖则常作为一个有限长度的完整识别单元,或附着在蛋白质和脂质上。糖链也常统称为 glycan;这个词强调由糖残基构成的结构,不限定它必须游离存在。2
单糖的碳骨架与立体化学¶
醛糖、酮糖与碳原子编号¶
开链单糖按潜在羰基分为醛糖和酮糖,并按碳原子数称为丙糖、丁糖、戊糖、己糖等。葡萄糖是己醛糖,果糖是己酮糖,核糖是戊醛糖。编号从最接近羰基的一端开始,使醛糖的醛基碳为 C1,常见酮糖的羰基则位于 C2。环化以后羰基不再以游离醛或酮的形式出现,但原羰基碳仍保留同一编号,并成为异头碳。
传统通式 \((\mathrm{CH_2O})_n\) 能描述葡萄糖等许多单糖,却不是糖类的定义。脱氧核糖少一个氧原子,氨基糖把羟基换成氨基衍生物,糖醛酸还多出羧基;这些分子仍属于糖类。判断一个分子时应看碳骨架与官能团的亲缘关系,而不是机械检查氢氧原子比。
Fischer 投影、D/L 构型与差向异构¶
Fischer 投影把碳链竖直放置,氧化程度最高的一端置于上方;横键朝向观察者,竖键背向观察者。投影在纸面内旋转 \(180^\circ\) 不改变构型,旋转 \(90^\circ\) 却会交换横、竖键的空间含义。它是一套记录立体关系的约定,不是分子在溶液中的真实伸展构象。3
单糖的 D/L 系列由开链结构中距离羰基最远的手性中心与甘油醛的相对构型决定。在标准 Fischer 投影中,该中心的羟基位于右侧为 D 系,位于左侧为 L 系。这个标记只约束一个构型参考中心;D-葡萄糖与 L-葡萄糖互为对映体,而 D-葡萄糖与 D-半乳糖并不是对映体。
两个分子若只有一个手性中心的构型不同而其余相同,称为差向异构体。D-葡萄糖与 D-甘露糖是 C2 差向异构体,D-葡萄糖与 D-半乳糖是 C4 差向异构体。若一个分子有 \(n\) 个相互独立的手性中心且不存在内部对称等简并因素,最多可有 \(2^n\) 个立体异构体;这个计数不能越过前提直接套到所有糖衍生物。
D/L 与旋光正负没有换算关系
D/L 描述相对构型,\((+)/(−)\) 描述给定温度、波长、溶剂和浓度下实测的旋光方向。D-果糖可以左旋,某些 L-糖也可以右旋。比旋光度必须同时给出测量条件;若浓度以 g/100 mL 表示,常写作 \([\alpha]^t_\lambda=100\alpha/(lc)\),其中 \(l\) 以 dm 计。
环化、异头体与变旋¶
单糖在水中通常不是一条固定的开链。醛基或酮基受到同一分子内羟基的亲核加成,形成环状半缩醛或半缩酮;这个环化过程不以脱水为定义,也不是羟醛缩合。D-葡萄糖的 C5 羟基进攻 C1 醛基时主要形成六元吡喃糖环。D-果糖的 C5 或 C6 羟基都可进攻 C2 酮基,所以水溶液中可同时出现呋喃糖、吡喃糖和少量开链形式。4
原羰基碳在环化时成为新的手性中心,即异头碳;只在异头碳构型不同的一对非对映体称为 α、β 异头体。α/β 的严格定义是异头中心相对于构型参考原子的关系。对常见 D-吡喃糖的 Haworth 投影,异头取代基与环外 \(\mathrm{CH_2OH}\) 位于相反侧通常记为 α,位于同侧通常记为 β;L 系糖的简化判读方向相反,不能把“向下就是 α”当作普遍规则。
具有游离半缩醛或半缩酮的环形可以开链,再从羰基两面闭合。纯 α-D-葡萄糖或 β-D-葡萄糖溶于水后,旋光度会随两种异头体和平衡中的开链形式重新分配而改变,这就是变旋。吡喃糖环还可在多种椅式及较高能的船式、扭船式构象间变化;β-D-吡喃葡萄糖的主要椅式构象使大取代基多处于赤道位,因而在水中较稳定。所谓异头效应则受环原子、取代基、溶剂和构象共同影响,不宜被简化为所有单糖中 α 异头体都更稳定。
单糖的官能团反应与生化衍生物¶
羰基的异构化、氧化与还原¶
开链形式的羰基比例虽小,却会不断由环形补充,因此能够驱动整批单糖参加羰基反应。碱催化的烯二醇重排可以在相邻碳之间移动羰基,使葡萄糖、甘露糖和果糖等醛糖、酮糖发生互变;反应范围受羰基与相邻羟基的位置限制,并不是任意手性中心都能在同一条件下互换。
| 起始官能团与转化 | 产物类别 | 代表关系 | 解释边界 |
|---|---|---|---|
| 醛基温和氧化 | 醛糖酸(aldonic acid) | 葡萄糖 → 葡糖酸 | 需要能够形成开链醛的还原端 |
| 醛基和末端伯醇同时氧化 | 糖二酸(aldaric acid) | 半乳糖 → 半乳糖二酸 | 产物是否有旋光性取决于整体对称性 |
| 末端伯醇选择性氧化 | 糖醛酸(uronic acid) | 葡萄糖 → 葡糖醛酸 | 生物体内通常由酶和活化糖供体途径实现 |
| 醛糖或酮糖羰基还原 | 醛糖醇(alditol) | 葡萄糖 → 山梨醇;甘露糖 → 甘露醇 | 酮糖还原可因新手性中心产生两种糖醇 |
能把温和氧化剂还原的糖称为还原糖。醛糖的开链醛基能够直接反应;果糖等酮糖在碱性条件下可经烯二醇异构为醛糖,也会给出阳性结果。Benedict、Fehling 或 Tollens 反应因此检测的是规定条件下可还原试剂的结构,不是对葡萄糖的专一鉴定。5
从异头碳判断还原端
若一个环状糖单位的异头碳仍是半缩醛或半缩酮羟基,它可以开环,所在一端就是还原端;若异头羟基已形成糖苷缩醛,便不能在相同条件下开环。二糖只要保留一个游离异头碳,整体仍可还原并发生变旋;两个异头碳都进入糖苷键时则为非还原糖。
羟基、异头中心与经典显色反应¶
单糖的多个羟基可成酯或成醚。磷酸化把葡萄糖、果糖、核糖等转变为带负电的代谢中间体,限制其自由跨膜并改变酶识别;糖核苷酸则把异头中心活化,作为糖基转移酶构建寡糖和糖缀合物的供体。具体水解反应断开 P—O 还是 C—O 键取决于底物和酶,不能仅由“糖磷酸”这个名称预先决定。
异头羟基与醇、胺、硫醇或碳亲核体形成 O-、N-、S- 或 C-糖苷。O-糖苷最常见,核苷中的核糖或脱氧核糖以 N-糖苷键连接碱基;C-糖苷的糖—配基连接对一般酸水解更稳定。形成糖苷后,异头中心从半缩醛转为缩醛,不再与开链羰基平衡,因而不发生变旋。
强酸和加热可使戊糖生成糠醛、己糖生成 5-羟甲基糠醛,早期糖分析据此发展出 Molisch、Seliwanoff 等显色反应。还原糖与苯肼形成糖脎,以及 Kiliani–Fischer 链延长、Wohl 链缩短,也曾用于建立单糖间的结构关系。今天这些反应仍有教学和特定分析价值,却通常不如色谱、酶法和质谱具有选择性。
经典糖反应的选择性边界
Molisch 反应提示可脱水成糠醛衍生物的糖类,Seliwanoff 反应利用酮糖通常更快的脱水显色,Benedict 反应报告还原能力;样品酸解、反应时间、共存还原剂和颜色背景都会改变结果。复杂样品不能只凭一种颜色或沉淀断言某个单糖的身份与含量。
重要单糖及其衍生物¶
| 碳骨架或衍生类型 | 代表分子 | 结构与生物学位置 |
|---|---|---|
| 三碳糖 | 甘油醛、二羟丙酮 | 最小的醛糖与酮糖骨架;相应磷酸酯是糖酵解中间体 |
| 五碳糖 | 核糖、2-脱氧核糖、核酮糖、木酮糖 | 核酸骨架及磷酸戊糖途径中的碳骨架 |
| 六碳糖 | 葡萄糖、半乳糖、甘露糖、果糖 | 能量代谢、寡糖和多糖最常见的母体单糖 |
| 脱氧糖 | 2-脱氧核糖、L-岩藻糖、L-鼠李糖 | 分别见于脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)、动物糖缀合物和植物/微生物糖链 |
| 氨基糖 | GlcN、GalN 及其 N-乙酰化形式 GlcNAc、GalNAc | 几丁质、糖蛋白、糖脂和糖胺聚糖的重要单体 |
| 糖醛酸 | 葡糖醛酸(GlcA)、艾杜糖醛酸(IdoA) | 提供羧酸负电荷,参与结合反应与糖胺聚糖结构 |
| 九碳糖酸 | 唾液酸家族,人体常见 Neu5Ac | 常位于脊椎动物糖链非还原末端,影响电荷和识别 |
| 醛糖醇与环醇 | 山梨醇、甘露醇;肌醇 | 前两者为羰基还原产物;肌醇是参与磷脂信号的环醇 |
N-乙酰胞壁酸(MurNAc)可理解为带乳酰基取代的 GlcNAc 衍生物,是细菌肽聚糖连接短肽的糖单位。唾液酸是一族九碳酸性单糖;同时写清碳数、官能团和糖链位置,比按分子大小排列更有化学意义。
糖苷键与寡糖¶
连接位置、异头构型与还原端¶
糖苷键名称要同时交代供体异头碳的构型和受体位置。例如 \(\mathrm{Gal\beta(1\rightarrow4)Glc}\) 表示半乳糖 C1 以 β 构型连接葡萄糖 C4 的氧。分支糖链中,一个残基的不同羟基可同时接受糖基,连接位置的选择与 α/β 构型共同产生远多于线性核酸或蛋白质序列的结构可能性。6
糖链通常从非还原端写向还原端。非还原端的末端异头碳已经形成糖苷键;还原端则保留能够开环的异头中心。一个分支聚糖可以有多个非还原端,却至多只有一个还原端。生物合成和降解酶常从特定端点或特定连接入手,所以“由哪些单糖组成”不足以预测糖链的反应性。
常见二糖的结构比较¶
| 二糖 | 残基与主要连接 | 还原性 | 结构意义 |
|---|---|---|---|
| 麦芽糖 | Glcα(1→4)Glc | 有 | 淀粉 α(1→4)-葡聚糖片段;还原端可变旋 |
| 纤维二糖 | Glcβ(1→4)Glc | 有 | 纤维素重复结构的二糖参照 |
| 乳糖 | Galβ(1→4)Glc | 有 | 哺乳动物乳汁中的主要二糖,水解需 β-半乳糖苷酶 |
| 龙胆二糖 | Glcβ(1→6)Glc | 有 | 展示 (1→6) 连接带来的额外旋转自由度 |
| 蔗糖 | Glcα(1↔2β)Fru | 无 | 两个异头碳彼此连接,不保留游离还原端 |
| α,α-海藻糖 | Glcα(1↔1α)Glc | 无 | 两个葡萄糖异头碳相连,见于昆虫、真菌和多种微生物 |
还原性二糖的还原端可以在 α、β 和开链形式之间平衡,因此系统命名若描述一份平衡样品,不应把还原端永久固定成某一异头体。蔗糖和海藻糖的两个异头中心都被占用,既不能变旋,也不参加常规还原糖反应。7
较长寡糖与环糊精¶
棉子糖在蔗糖的葡萄糖 C6 上接入一个 α(1→6) 半乳糖,水苏糖等棉子糖家族成员继续从这一端延长。因为蔗糖核心的两个异头碳已经相连,外加的半乳糖也以自身异头碳成键,这些分子没有游离还原端。人乳寡糖则以乳糖为核心,常由岩藻糖、唾液酸、半乳糖和 GlcNAc 延伸;婴儿对其直接消化能力有限,它们主要作为肠道微生物底物,并可参与阻断某些病原体黏附。2
环糊精由 α(1→4) 连接的葡萄糖首尾成环,α、β、γ-环糊精分别常含 6、7、8 个葡萄糖残基。羟基主要朝向外表面,环腔相对疏水,因此可以包合尺寸合适的非极性分子。这样的主—客体结合可用于改善某些化合物的溶解、稳定或递送;催化能力则需要另由反应动力学和机制证据确认。
多糖的连接方式与材料性质¶
淀粉与糖原¶
淀粉和糖原都由 α-D-葡萄糖构成,主链以 α(1→4) 键延伸,分支点由 α(1→6) 键产生。淀粉由直链淀粉与支链淀粉共同组织成半晶质颗粒;糖原则形成高度分支、与蛋白质和代谢酶结合的胞质颗粒。二者的差异包括支链长度分布、分支点的空间组织和大分子装配状态。8
| 性质 | 直链淀粉 | 支链淀粉 | 糖原 |
|---|---|---|---|
| 主要连接 | α(1→4),可含少量分支 | α(1→4) 主链与成簇的 α(1→6) 分支 | α(1→4) 主链与更频繁的 α(1→6) 分支 |
| 高级组织 | 可形成单螺旋或参与双螺旋和结晶区 | 支链簇形成双螺旋并组织淀粉颗粒 | 较短链形成紧凑、较水合的颗粒 |
| 端点 | 一个还原端,通常一个非还原端 | 一个还原端,多个非还原端 | 一个还原端,大量非还原端 |
| 生理位置 | 植物淀粉颗粒的组分 | 植物淀粉颗粒的主要组分 | 动物、真菌和许多微生物的快速动员储存物 |
分支把许多非还原端集中在一个颗粒表面,使合成酶和降解酶能够并行作用;它也限制长链规则堆积。淀粉粒在水中加热时吸水、失去部分有序结构并增稠,称为糊化。冷却和储存过程中,葡聚糖链重新缔合并形成更有序区域,称为回生;直链淀粉和支链淀粉都可发生不同程度的回生,具体程度由二者比例、含水量、温度和时间共同决定。
碘进入某些葡聚糖螺旋形成有色复合物,颜色随链长、分支和构象改变,所以直链淀粉常呈深蓝,支链淀粉和糖原则偏紫红或棕红。α-淀粉酶内切 α(1→4) 键,迅速降低长链黏度并产生麦芽寡糖和极限糊精;β-淀粉酶从非还原端依次释放麦芽糖,在植物和部分微生物中存在。两者都不能越过 α(1→6) 分支,完整降解还需要去分支酶。
纤维素、几丁质与其他同多糖¶
纤维素与淀粉都只含葡萄糖,却因 β(1→4) 与 α(1→4) 的差别形成不同材料。β(1→4)-葡聚糖偏好伸展构象,相邻链可以排列成含结晶区和无定形区的微纤丝;大多数动物缺少能有效水解纤维素的内源酶。几丁质把葡萄糖 C2 的羟基换成乙酰氨基,形成 β(1→4)-GlcNAc 链,并与蛋白质或矿物组装为真菌细胞壁和节肢动物外骨骼的一部分。2
| 多糖 | 主要残基与连接 | 典型分布或性质 |
|---|---|---|
| 纤维素 | Glcβ(1→4) | 植物细胞壁微纤丝的承力骨架 |
| 几丁质 | GlcNAcβ(1→4) | 真菌细胞壁、节肢动物外骨骼及其他动物结构 |
| 菊粉 | Fruβ(2→1),常以末端蔗糖样结构起始 | 菊科等植物的储存果聚糖,链长依来源而变 |
| 海带多糖/昆布多糖 | 以 Glcβ(1→3) 为主,可含 β(1→6) 分支 | 褐藻等的储存葡聚糖 |
| 胼胝质 | 以 Glcβ(1→3) 为主并含少量 β(1→6) 分支 | 植物筛板、胞间连丝和损伤反应中的动态壁成分 |
| 甘露聚糖 | 以 Man 为主,连接和支化依来源而异 | 植物细胞壁、种子储存物及真菌/微生物结构 |
| 右旋糖酐 | 以 Glcα(1→6) 主链为主,常有不同分支 | 多种细菌的胞外多糖;交联衍生物可作凝胶过滤基质 |
同一种聚合物还可能有不同链排列和晶型。天然纤维素存在平行链占优势的 cellulose I,经过溶解再生或碱处理可形成反平行链占优势的 cellulose II;几丁质也有 α、β、γ 等晶型。把“纤维素只能平行、几丁质才能反平行”当作类别定义,会忽略加工历史和多晶型。
植物、藻类与微生物基质多糖¶
植物初生细胞壁是纤维素微纤丝、半纤维素、果胶、蛋白质和水组成的复合材料。半纤维素是木聚糖、木葡聚糖、甘露聚糖等壁多糖的总称。果胶则由同型半乳糖醛酸聚糖、鼠李半乳糖醛酸聚糖等多个结构域组成。9
| 材料多糖 | 结构主线 | 性质与用途 |
|---|---|---|
| 果胶 | 富含 GalA 的多种结构域,可有甲酯化、乙酰化及中性糖支链 | 带负电并能形成水合网络;参与植物壁孔隙与黏附,亦用于凝胶体系 |
| 半纤维素 | 木聚糖、木葡聚糖、葡甘露聚糖等异质家族 | 与纤维素和其他壁组分共同调节壁的强度与可塑性 |
| 琼脂糖 | Gal 与 3,6-脱水-L-Gal 交替的线性链 | 热水溶解、冷却成凝胶;用于微生物培养基和电泳介质 |
| 卡拉胶 | 硫酸化 Gal/3,6-脱水-Gal 重复链 | 硫酸化程度与离子环境决定不同凝胶和增稠性质 |
| 黄原胶 | β(1→4)-葡聚糖主链带含 Man、GlcA 等的侧链 | 细菌胞外多糖,溶液黏度高;主链不是 α(1→4) |
这些多糖的溶解、凝胶或沉淀行为由链长、分支、取代、链间缔合、温度、离子、浓度和加工历史共同决定。
细胞表面糖链与糖缀合物¶
细菌细胞壁与外膜糖链¶
肽聚糖以 GlcNAc 与 MurNAc 交替的 β(1→4) 糖链为骨架,短肽连接在 MurNAc 上,并在相邻链之间交联成网。典型革兰阳性菌只有一层细胞膜,外侧肽聚糖较厚,并可带壁磷壁酸;脂磷壁酸则由脂质部分锚定在膜中。典型革兰阴性菌的薄肽聚糖位于内、外膜之间的周质,外膜外层富含脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)。真实细菌还存在不符合这套简图的膜层与染色类型,因此厚薄和附加聚合物比“阳性必经桥联、阴性必直接交联”更可靠。10
LPS 由锚入外膜的 lipid A、核心寡糖和向外延伸的 O 抗原构成。核心常含 Kdo 与庚糖,O 抗原则由菌株特异的重复单位组成;缺少长 O 抗原而只保留扩展核心的相关分子常称脂寡糖。肽聚糖水解酶或自溶素切开既有键,为生长、分裂和重塑提供空间,但必须与新材料合成协调,不能把它们等同于“插入新结构单位”的合成酶。
糖蛋白的连接与微观不均一性¶
糖蛋白上的 N-糖链通过 GlcNAc 连接天冬酰胺(Asn)侧链氮,经典序列背景为 Asn-X-Ser/Thr,即天冬酰胺后隔任一非脯氨酸残基,再接丝氨酸或苏氨酸;黏蛋白型 O-糖链则常从 GalNAc 连接丝氨酸或苏氨酸羟基开始。糖链的延伸、修剪、分支和末端修饰由内质网与高尔基体中一组糖基转移酶、糖苷酶和供体浓度共同决定,呈现与模板复制不同的合成逻辑。
同一蛋白质的同一位点可能携带组成或分支不同的糖链,称为微观不均一性。糖型会随细胞类型、发育状态和生理环境变化;疾病样品中观察到的免疫球蛋白 G(immunoglobulin G,IgG)等糖链变化可以成为机制线索或生物标志候选,却不能脱离研究设计自动解释为疾病的单一病因。
糖胺聚糖与蛋白聚糖¶
蛋白聚糖的定义性特征是核心蛋白连接一条或多条糖胺聚糖(glycosaminoglycan,GAG),而不是简单要求“糖的质量一定大于蛋白质”。除硫酸角质素外,常见 GAG 的重复二糖含氨基糖与糖醛酸,并可在不同位置硫酸化;羧酸与硫酸基使链带有高密度负电荷,吸引对离子和水,形成扩展的水合结构。11
| GAG | 重复结构的主要特征 | 与其他 GAG 的区别 |
|---|---|---|
| 透明质酸 | GlcA 与 GlcNAc 交替 | 不硫酸化,通常不共价连接核心蛋白;在质膜处合成 |
| 硫酸软骨素/皮肤素 | GalNAc 与 GlcA 或 IdoA 交替并硫酸化 | 常见于软骨和其他细胞外基质蛋白聚糖 |
| 肝素/硫酸乙酰肝素 | GlcN 与 GlcA/IdoA 组成,N-与 O-硫酸化模式多样 | 通过特定硫酸化片段与凝血因子、生长因子等蛋白结合 |
| 硫酸角质素 | 硫酸化 Gal–GlcNAc 重复链 | 主要 GAG 中唯一不以糖醛酸作为重复二糖组分者 |
GAG 的功能不由总负电荷单独决定。重复单位、艾杜糖醛酸构象、硫酸化位置和连续结构域共同改变蛋白结合;蛋白聚糖的核心蛋白又决定定位和可接近性。糖链既形成抗压、保水的细胞外基质,也参与生长因子分布、凝血和细胞黏附。
糖链结构分析¶
聚糖没有简单的模板序列,且同分异构体众多。两个样品可以具有相同单糖组成和相同质量,却在连接位置、α/β 构型、分支或硫酸化位置上不同。结构分析因而不是“测一次分子量再读序列”,而是从样品来源、连接对象和所需分辨率出发,组合化学、酶学、色谱、质谱和核磁共振证据。12
| 分析层次 | 常用方法 | 能回答的问题 | 主要限制 |
|---|---|---|---|
| 糖缀合物富集与糖链释放 | 凝集素或抗体亲和;PNGase F 等酶法;规定条件下的化学释放 | 哪类糖缀合物、N-或 O-糖链是否存在 | 选择性会漏掉不匹配结构,释放还可能损伤敏感取代基 |
| 单糖组成 | 水解后以高效液相色谱(high-performance liquid chromatography,HPLC)、气相色谱(gas chromatography,GC)或质谱(mass spectrometry,MS)作衍生化分析 | 各单糖的大致种类和比例 | 丢失原始顺序、分支和连接信息 |
| 连接与支化 | 甲基化连接分析、高碘酸氧化/Smith 降解 | 哪些羟基曾参与成键、支链端点比例 | 样品量、反应完全性和共存取代基影响解释 |
| 顺序与异构体 | 外切/内切糖苷酶阶梯、液相色谱(liquid chromatography,LC)分离、串联质谱(MS/MS)、离子淌度 | 候选序列、分支、部分连接和异构体信息 | 同质量单糖和多种连接可产生重叠信号,常不能单独唯一确证 |
| 构型与三维环境 | 一维/多维核磁共振(nuclear magnetic resonance,NMR) | 异头构型、连接位置、构象和动力学 | 需要较多且较纯样品,复杂混合物谱峰易重叠 |
| 识别功能 | 凝集素印迹、糖链微阵列、表面结合测定 | 蛋白质或抗体偏好结合哪些展示糖链 | 报告结合而非直接给出未知糖链的完整序列 |
现代基质辅助激光解吸/电离(matrix-assisted laser desorption/ionization,MALDI)或电喷雾电离(electrospray ionization,ESI)质谱可以在少量样品中获得完整分子和碎片离子的质荷比 \(m/z\),与液相色谱联用后还能分开部分同分异构体。但 Glc、Gal、Man 等具有相同单糖质量,连接异构体也可能产生相近碎片;可靠鉴定常须与标准品、特异糖苷酶、连接分析和 NMR 互证。糖链微阵列则把已知糖结构固定在表面,用于比较凝集素、抗体或受体的结合偏好,它属于功能测定而不是测定未知聚糖序列的替代品。
从单糖走向糖链,结构信息沿异头构型、连接位置、分支和修饰四个相互耦合的维度增加。后续讨论糖酵解、糖原合成与分解及其他糖代谢时,这些维度将决定酶能识别哪一个键、从哪一端反应,以及产物进入哪条代谢路径。
参考资料与延伸阅读¶
- Nelson, D. L., Cox, M. M. & Hoskins, A. A. Lehninger Principles of Biochemistry, 8th ed., Chapter 7. Macmillan Learning, 2021.
- IUPAC–IUBMB Joint Commission on Biochemical Nomenclature. Nomenclature of Carbohydrates (Recommendations 1996).
- OpenStax. Organic Chemistry, Chapter 25: Classification of Carbohydrates, Cyclic Structures of Monosaccharides: Anomers, Reactions of Monosaccharides, Disaccharides, Polysaccharides and Their Synthesis.
- Varki, A. et al., eds. Essentials of Glycobiology, 4th ed.: Monosaccharide Diversity, Oligosaccharides and Polysaccharides, Proteoglycans and Sulfated Glycosaminoglycans, Eubacteria, Viridiplantae and Algae and Structural Analysis of Glycans. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2022.
- Tetlow, I. J. & Emes, M. J. A review of starch-branching enzymes and their role in amylopectin biosynthesis. IUBMB Life 66, 546–558 (2014).
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Lebrilla, C. B. et al. Oligosaccharides and Polysaccharides. In Essentials of Glycobiology, 4th ed. (2022)。 ↩↩↩
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OpenStax, Representing Carbohydrate Stereochemistry: Fischer Projections;D,L Sugars。 ↩
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OpenStax, Cyclic Structures of Monosaccharides: Anomers;Seeberger, P. H. Monosaccharide Diversity. In Essentials of Glycobiology, 4th ed. (2022)。 ↩
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Mohnen, D. et al. Viridiplantae and Algae. In Essentials of Glycobiology, 4th ed. (2022)。 ↩
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Schäffer, C. et al. Eubacteria. In Essentials of Glycobiology, 4th ed. (2022)。 ↩
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Esko, J. D. et al. Proteoglycans and Sulfated Glycosaminoglycans. In Essentials of Glycobiology, 4th ed. (2022)。 ↩
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Packer, N. H. & Zaia, J. Structural Analysis of Glycans. In Essentials of Glycobiology, 4th ed. (2022)。 ↩
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